Sejarah Desa Margacinta bukanlah sebatas nama sebuah desa, lebih dari itu memuat pesan nilai dan moral yang teramat jelas sesuai dengan nilai- nilai dan keyakinan keislaman dari para Founding Father nya, Margacinta adalah gabungan dua kata Marga berarti Jalan dan Cinta berarti kasih sayang sejati. Dalam nama margacinta, sesungguhnya terkandung tekad untuk menyediakan jalan ( sarana) bagi tumbuh berkembangnya cinta kasih sebagai landasan nilai dan prilaku kehidupan masyarakat setempat, sebagaimana tuntutan kesadaran fitrah sebagai hamba dan khalifah Alloh di muka bumi. Adapun Kepala Desa yang pernah memimpin Desa Margacinta adalah sebagai berikut : Tahun atau Periode 1920-1930 H. Siraj 10 tahun 1930-1939 H. Munji 9 Tahun 1939-1949 Suhita Atmaja 10 Tahun 1949-1958 Engkon Ruslan 9 Tahun 1958-1964 Mahmud 6 Tahun 1964-1966 Lili Jahidi 2 Tahun 1966-1970 Suharma 4 Tahun 1973-1982 Oha Efendi 9 Tahun 1985-1992 Sarip Samsudin 7 Tahun 1994-2003 Erom Rohmat 9 Tahun 2003-2015 Drs. Awan Setiawan 12 Tahun 2015-Sekarang Acep Gandi Sampai sekarang